1999~2009

• 1999년10.허준(구암)기념관 건립계획 수립
• 2000년05.31건립 부지매입
• 2001년12.15설계경기 공고
• 2002년04.설계경기 작품심사 및 당선작 선정
• 05.22설계용역계약
• 12.설계용역 납품 및 준공검사
• 2003년02.시공업체 선정
• 04.10공사착공
• 2004년11.20건축준공
• 2005년03.23개관
• 04.29개관기념 세미나 "한의학으로 본 감기"
• 05.12「1종 전문박물관」등록(제13호)
• 06.30개관 100일 기념행사
• 10.0810만번째 관람객 입장
• 11.23서울사랑시민상 '건축상' 수상
• 2006년01.17보물2점 지정
• 03.23개관1주년 행사
• 특별전 : 지리산 함양 약초전
• 학술세미나 :「동의보감」의 역사적 철학적 고찰
• 07.27~28제1회 여름방학프로그램 어린이 허준교실> 운영
• 10.14~15제8회 의성허준축제 기념 약초 표본 전시회
• 2007년01.2320만번째 관람객 입장
• 03.23개관2주년 행사
• 특별전 :「동의보감」속의 약선, 한방 떡과 차
• 학술세미나 :「동의보감」과 건강법
• 2008년03.21개관3주년 행사
• 특별전 : 「동의보감」 속 약재 특별전
• 학술세미나 : 허준과 전염병
• 2009년03.21개관4주년 행사
• 학술세미나 : 허준 관련 인물 연구
• 10.2440만번째 관람객 입장

2010~현재

• 2010년03.23개관5주년 행사
• 특별전 : 
  「동의보감」 완성400주년 기념 「동의보감」특별전
• 학술세미나 : 
  「동의보감」의 학문적 특징과 미래적 가치
• 2011년03.23개관6주년 행사
• 특별전 : 신소장품 특별전
• 학술세미나 : 허준의 언해본 재조명
• 06.1150만번째 관람객 입장
• 2012년03.21개관7주년 행사
• 학술세미나 : 
  현대적 관점에서 본 「동의보감」의 양생 사상
  재조명
• 03.23~04.29특별전 : 건강을 지켜주는 부적 특별전
• 11.17 60만번째 관람객 입장
• 2013년10 01~11.30동의보감 발간 400주년 및 개관8주년 기념 
  「동의보감과 약재의향기」
• 10.12동의보감 발간 400주년 기념 국제학술대회 
  「동의보감의 영향과 활용」
• 2014년03.21개관9주년 행사
• 학술세미나 :
  「동의보감」의 심신수련과 현대사회의
  힐링과의 소통
• 06.1570만번째 관람객 입장
• 10.07~11.30국립민속박물관 공동기획전 :
  약장, 건강을 염원하다.
• 2015년03.24개관10주년 행사
• 학술세미나 : 동의보감 재조명
• 10.07~11.30특별전 : 십장생, 건강장수를 바라다
• 2016년03.24개관11주년 행사
• 04.80만번째 관람객 입장
• 06.20~10.06박물관 내부 리모델링 공사
• 10.07재개관식
• 10.07~12.31특별전 : 신소장품전